Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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