Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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ZNF439Q8NDP4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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ZNF439Q8NDP4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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ZNF439Q8NDP4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF439Q8NDP4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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