Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms