Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TRAPPC6BQ86SZ2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TRAPPC6BQ86SZ2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TRAPPC6BQ86SZ2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TRAPPC6BQ86SZ2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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