Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUFY3Q7L099 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms