Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD2Q6Y1H2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD2Q6Y1H2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms