Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms