Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HES3Q5TGS1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms