Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms