Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB6CQ53S08 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB6CQ53S08 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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