Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPAT3Q53EU6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms