Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYTL3Q4VX76 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms