Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KNOP1Q1ED39 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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