Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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