Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP6Q16828 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP6Q16828 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms