Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP2Q16527 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP2Q16527 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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