Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F4Q16254 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
E2F4Q16254 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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