Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHRNA2Q15822 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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