Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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