Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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