Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIX1Q15475 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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