Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
UBE3CQ15386 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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