Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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RABEP1Q15276 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RABEP1Q15276 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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