Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PTPRRQ15256 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRRQ15256 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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