Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
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