Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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COL4A6Q14031 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
COL4A6Q14031 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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