Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTR4Q13639 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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