Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDH18Q13634 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms