Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNASE1L3Q13609 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms