Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTGDRQ13258 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTGDRQ13258 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTGDRQ13258 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTGDRQ13258 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTGDRQ13258 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTGDRQ13258 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PTGDRQ13258 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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