Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHAF1AQ13111 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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