Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
IFT88Q13099 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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IFT88Q13099 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IFT88Q13099 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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