Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GPS1Q13098 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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GPS1Q13098 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GPS1Q13098 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GPS1Q13098 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GPS1Q13098 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GPS1Q13098 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GPS1Q13098 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GPS1Q13098 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GPS1Q13098 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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GPS1Q13098 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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GPS1Q13098 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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