Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM2Q13029 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM2Q13029 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms