Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2AQ12879 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms