Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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