Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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KCNMA1Q12791 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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KCNMA1Q12791 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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KCNMA1Q12791 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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KCNMA1Q12791 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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KCNMA1Q12791 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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KCNMA1Q12791 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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KCNMA1Q12791 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KCNMA1Q12791 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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KCNMA1Q12791 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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KCNMA1Q12791 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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KCNMA1Q12791 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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KCNMA1Q12791 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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