Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms