Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CD47Q08722 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD47Q08722 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD47Q08722 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD47Q08722 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms