Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms