Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFITM3Q01628 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms