Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN2P57739 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN2P57739 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms