Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EPHB3P54753 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms