Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP53609 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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