Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGDP52209 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGDP52209 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGDP52209 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGDP52209 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGDP52209 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGDP52209 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms