Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMARCA4P51532 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMARCA4P51532 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms