Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP4P49662 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP4P49662 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP4P49662 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP4P49662 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP4P49662 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP4P49662 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP4P49662 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP4P49662 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP4P49662 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms