Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
KRT6CP48668 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRT6CP48668 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms