Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAPZBP47756 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms