Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
XCR1P46094 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCR1P46094 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCR1P46094 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCR1P46094 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCR1P46094 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCR1P46094 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCR1P46094 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
XCR1P46094 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms